Algemene Nintendo-accounts en Nintendo-kinderaccounts verschillen op de volgende manieren:

• Er kan geen e-mailadres geregistreerd worden voor een kinderaccount. E-mailberichten worden verstuurd naar het e-mailadres dat geregistreerd is voor de Nintendo-account van de ouder/voogd.
• Nintendo-kinderaccounts kunnen aangemaakt worden voor gebruikers van 0 t/m 17 jaar. Algemene Nintendo-accounts kunnen alleen worden aangemaakt door gebruikers van 16 jaar en ouder die over een e-mailadres beschikken.
• Sommige My Nintendo-missies kunnen alleen voltooid worden door gebruikers met een Nintendo-account.
• Nintendo-kinderaccounts kunnen alleen gekoppeld worden met een Nintendo Network ID. Ze kunnen niet gekoppeld worden aan Google- of Apple-accounts.
• Alle Nintendo-accounts voor kinderen onder de 15 jaar worden automatisch ingesteld als accounts onder toezicht in de Nintendo-accountfamiliegroep.

Afgezien van deze punten, werken ze vrijwel hetzelfde.