母星に持ち帰るために、ピクミンの力を借りて少しでも多くの食料をあつめなければならない。また、この星で長く探索を続けるための食料にも、気を配らなければ。
原生生物は夜になると狂暴になるため、 探索は日が暮れると終了。 日没までの間に探索範囲を広げ、食料を確保しながら 無駄のない行動をすることが求められる。
惑星は広い。 隊員同士でうまくピクミンをやりくりして、 手分けをすれば効率もきっと上がるはずだ。