Alle derzeit verfügbare Software, die für Nintendo DS-Systeme veröffentlicht wurde, kann mit dem Nintendo DSi-System verwendet werden. Da der Nintendo DSi jedoch nicht über einen Game Boy Advance-Modulschacht verfügt, können manche Nintendo DS-Spiele, die den GBA-Modulschacht verwenden, oder einige der darin enthaltenen Spielfeatures, nicht genutzt werden. Dies betrifft Spiele, bei denen Daten zwischen der Nintendo DS-Karte und einem Game Boy Advance-Modul übertragen werden, oder Spiele, bei denen ein Zubehör verwendet wird, das in den GBA-Modulschacht eingesteckt wird.

Nachfolgend finden Sie eine Liste von Nintendo DS-Produkten, die mit dem Nintendo DSi-System nicht (voll) kompatibel sind:

• "Guitar Hero On Tour" und "Guitar Hero Decades" sind nicht spielbar.
• Manche Features sind in den folgenden Spielen nicht verfügbar: "Pokémon Diamant-Edition", "Pokémon Perl-Edition", "Pokémon Platin-Edition", "Pokémon Dash" und "Pokémon Mystery Dungeon: Team Blau".
• Das folgende Zubehör kann nicht verwendet werden: Nintendo DS Rumble Pak, Nintendo MP3 Player, Nintendo DS Browser, Nintendo DS Lite Browser, Nintendo DS Memory Expansion Pak (Speichererweiterung), Nintendo DS Lite Memory Expansion Pak (Speichererweiterung), Guitar Hero "Guitar Grip".